يستخدم هذا التحليل تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) للكشف النوعي (وأحياناً الكمي/النوعي) عن الحمض النووي (DNA) الخاص بأنواع فيروس الورم الحليمي البشري (HPV) في العينات السريرية (مثل مسحات عنق الرحم، مسحات من مناطق أخرى، أو الأنسجة). يمكن أن يكون الاختبار نوعياً لأنواع محددة (مثل النوع 16 و 18 فقط) أو شاملاً لمجموعة واسعة من الأنواع عالية الخطورة (مثل 16، 18، 31، 33، 35، 39، 45، 51، 52، 56، 58، 59، 66، 68). يعد الكشف عن الحمض النووي مؤشراً على وجود عدوى نشطة.