باقة فحوصات مخبرية تعتمد على تقنيات الزراعة المجهرية والجزيئية للكشف عن وجود وتعداد الكائنات الحية الدقيقة (البكتيريا، الفطريات، والطفيليات أحياناً) في عينات الماء. تشمل فحص مؤشرات التلوث البرازي (مثل بكتيريا القولونيات الكلية والبرازية) والبكتيريا المتطفلة الأخرى. تُستخدم لتقييم السلامة الميكروبيولوجية للمياه ومدى صلاحيتها للشرب أو الاستخدام.