فحص جزيئي يعتمد على تفاعل البوليميراز المتسلسل (Polymerase Chain Reaction - PCR) للكشف النوعي والتفريقي عن الحمض النووي (DNA) لفيروس الهربس البسيط من النوع 1 (HSV-1) والنوع 2 (HSV-2) في العينات السريرية. تُعد هذه التقنية هي الأكثر حساسية لتشخيص العدوى النشطة، حيث يمكنها اكتشاف كميات ضئيلة جداً من الفيروس في السائل النفطي (الحويصلي) أو سوائل الجسم أو مسحات الآفات.